山藥薯塊耐寒，必要時可以就地貯存，延遲至次年3月上中旬采收。也可用土窯貯藏，窖中山藥與沙土相間層積貯藏，最后覆土呈屋脊形，上蓋稻草防止雨水侵入。窖內保持10℃～15℃，一直可貯存到次年4～5月。山藥塊莖休眠期較耐低溫，在短期-4℃以下不表現凍害。適宜的貯藏溫度為0℃～2℃，相對濕度90%左右。常用的貯藏方法如下：

1．溝藏法：挖1～2米深、寬1米左右的溝，挖出的山藥立即排放入溝，一層山藥一層土，不超過80厘米，頂部蓋一層細土。隨著氣溫下降，加蓋覆土，以凍土層距山藥頂部厚度5～10厘米為宜，可貯藏至翌年3～4月。

2．埋藏法：又稱沙藏法。在倉庫或室內的水泥坪上，用磚砌起高1米左右的埋藏坑。在坑底鋪上10厘米的干凈細砂或細土。把經挑選的山藥按次序平放在沙上，一層山藥一層細沙，堆至離坑口10厘米左右時，再用細泥或黃沙密封。每隔一個月倒動檢查一次。山藥也可放在筐、箱內用沙埋藏。

3．筐藏法：把日曬消毒的稻草或麥草鋪墊在消過毒的筐或箱四周。然后把選好的山藥逐層堆至八分滿，上面用麥草覆蓋。最后堆放在庫房內，保持庫內適溫，為防止地面濕氣，可在筐底墊上磚頭或木板。