1、肝素是需要迅速達到抗凝作用的首選藥物，可用于外科預防血栓形成以及妊娠者的抗凝治療，對于急性心肌梗死患者，可用肝素預防病人發(fā)生靜脈栓栓塞病，并可預防大塊的前壁透壁性心肌梗死病人發(fā)生動脈栓塞等。

2、肝素的另一重要臨床應用是在心臟、手術和腎臟透析時維持血液體外循環(huán)暢通。

3、用于治療各種原因引起的彌散性血管內(nèi)凝血（DIC），也用于治療腎小球腎炎、腎病綜合征、類風濕性關節(jié)炎等。