(1)骨髓抑制為最常見的毒性，白細胞往往在給藥后10一14天最低，多在第21天恢復正常，血小板減少比其他烷化劑少見；常見的副反應(yīng)還有惡心、嘔吐。嚴重程度與劑量有關(guān)。

(2)環(huán)磷酰胺的代謝產(chǎn)物可產(chǎn)生嚴重的出血性膀胱炎、大量補充液體可避免。本品也可致膀胱纖維化。

(3)當大劑量環(huán)磷酰胺(按體重50mg/kg)與大量液體同時給予時，可產(chǎn)生水中毒，可同時給予呋塞米以防止。

(4)常規(guī)劑量的環(huán)磷酰胺不產(chǎn)生心臟毒性，但當高劑量時可產(chǎn)生心肌壞死，偶有發(fā)生肺纖維化。

(5)環(huán)磷酰胺可引起生殖系統(tǒng)毒性，如停經(jīng)或精子缺乏，妊娠初期時給予可致畸胎。

(6)長期給予環(huán)磷酰胺可產(chǎn)生繼發(fā)性腫瘤。

(7)環(huán)磷酰胺可產(chǎn)生中等至嚴重的免疫抑制。

(8)用于白血病或淋巴瘤治療時，易發(fā)生高尿酸血癥及尿酸性腎病。

(9)少見的副作用有發(fā)熱、過敏、皮膚及指甲色素沉著、粘膜潰瘍、肝功能丙氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶升高、蕁麻疹、口咽部感覺異?；蛞暳δ：?。食欲不振,惡心,脫發(fā),骨髓抑制,白細胞及血小板減少,引起肝損害,大劑量可引起膀胱刺激癥狀或膀胱炎,血尿,蛋白尿,嘔吐.個別有頭暈,幻覺,不安等。

常見的不良反應(yīng)為胃腸不能耐受、骨髓受抑制、脫發(fā)及無菌性膀胱炎，但許多組織及器官都能受影響。應(yīng)用此藥治療惡性病如多發(fā)性骨髓瘤、慢性淋巴性白血病、卵巢癌，可引起急性白血病。用它治療非惡性病時如類風濕性關(guān)節(jié)炎，可發(fā)生膀胱癌。應(yīng)用大劑量的患者可發(fā)生心肌壞死、急性心肌炎，并可致心衰，甚至死亡。應(yīng)用此藥治療不常見有肺纖維化，罕見有肝損害伴肝酶暫時升高。此藥可引起口炎；可致睪丸損害并伴有不育癥，并與劑量有關(guān)；也可引起卵巢功能紊亂，也與劑量及年齡有關(guān)。有報告護士處理此藥時可發(fā)生過敏反應(yīng)。

心血管系統(tǒng)：此藥可引起心肌病、局灶性穿壁性心肌出血及冠狀動脈炎。大劑量，120～240mg/kg可致出血性心肌壞死，并在最后一劑的2周后可發(fā)生心衰。此藥對毛根有毒性作用，常見有彌漫性脫發(fā)。

肝臟毒性：本品可劑量依賴性的引起肝損傷，這可能是由于環(huán)磷酰胺的主要代謝物丙烯醛(acrolein)的肝臟毒性作用，引起肝細胞壞死，肝小葉中心充血，并伴隨氨基轉(zhuǎn)移酶升高。

消化系統(tǒng)：最常見的不良反應(yīng)是惡心、嘔吐，發(fā)生率大約為60%～90%，這也是病人不能耐受的主要原因。雖然5-HT阻斷劑胃復安可以減輕這一不良反應(yīng)，但應(yīng)密切注視隨之而來的神經(jīng)抑制作用。

泌尿系統(tǒng)和腎毒性：本品可以引起腎出血、膀胱纖維化及出血性膀胱炎、腎盂積水、膀胱尿道返流、甚至繼發(fā)腎癌，但與其他烷化劑抗癌藥相比，本品的腎毒性相對較低。

皮膚、粘膜：不論是單獨使用或與其他藥物合并使用，本品均影響毛囊細胞的分裂，對頭發(fā)、毛囊均有明顯毒性。用藥后引起脫發(fā)的程度是劑量相關(guān)的，停藥后可逐漸長出新發(fā)。由于本品可以抑制口腔粘膜的快速增殖，引起口腔炎，也可引起藥物性皮炎，與其他藥物合并使用，也偶見指甲脫落和色素沉著。

生殖毒性：本品對生殖系統(tǒng)有較明顯的毒性，引起男子精子缺乏，降低睪丸間質(zhì)細胞功能，女子卵巢損傷。