該科植物富含異哇啉類生物堿 (isoquinolinetype alkaloids) ，如前鴉片堿 (protopine) 、異紫堇堿 (isocorydine) 、罌粟堿 (papaverine) 、嗎啡 (morphine) 、可待因 (codeine) , 還有血根堿 (sangulnarine) 、白屈菜堿 (chelerythrine) 、博落回堿 (bocconine) 、痕跡那可汀 (narcotine) 、蒂巴因 (thebaine) 等。?按化學結構又可分為苯菲里啶(bcnzo[C]Phenantridine)型、原小檗堿(berberine)型、原阿片堿(protopine)型、苯甲基異喹啉(benzylisoquinoline)型、嗎啡(morphinane)型、麗春花堿(rhoeadane)型、酞基四氫異喹啉(phthalidetetrahyroisoqmnoline)型等。