福建醫(yī)科大學附屬第二醫(yī)院是福建省泉州市國家級住院醫(yī)師規(guī)范化培訓基地，福建醫(yī)科大學附屬第二醫(yī)院、第二臨床醫(yī)學院是泉州地區(qū)現(xiàn)代醫(yī)學的發(fā)祥地，是我省主要的醫(yī)療、教學、科研基地之一，是福建省首批通過衛(wèi)生部評審的四家三級甲等綜合性醫(yī)院之一，是博士、碩士研究生學位授權點單位。醫(yī)院始建于1881年，為英國教會醫(yī)院，原名“惠世醫(yī)院”，解放后，改為晉江專區(qū)第二醫(yī)院。1973年升格為福建醫(yī)科大學附屬第二醫(yī)院。2000年成為福建醫(yī)科大學第二臨床醫(yī)學院，2002年成為福建醫(yī)學會風濕病學分會主任委員單位，2012年成為福建醫(yī)學會變態(tài)反應學分會主任委員單位。

醫(yī)院病床編制2000張，設鯉城和東海兩個院區(qū)，鯉城院區(qū)占地24.57畝，目前開放病床1172張；在建的東海院區(qū)占地142.6畝，規(guī)劃床位1000張，2015年初一期門急診醫(yī)技樓、?？撇》繕钦酵度胧褂?，開放床位300張，核心病房樓建設也已啟動。此外還設非行政隸屬分院石獅市醫(yī)院和晉江市醫(yī)院。目前醫(yī)院在編人員1579人，合同制人員842人，高級職務人員309人，衛(wèi)生部突出貢獻中青年專家1人、國務院特殊津貼專家6人、全省百千萬人才6人、全省衛(wèi)生系統(tǒng)跨世紀學術和技術學科帶頭人19人、福建醫(yī)科大學學科帶頭人10人，兼任國家、省、市專業(yè)學會主任委員10人，各專業(yè)學會副主任委員（副會長）44人、常務委員（常務理事）83人、委員（理事）181人，博碩士364人。

醫(yī)院倡導科學精神與人文精神相結合的治院方略，歷來以外科技術精湛著稱，上世紀四、五十年代率先在泉州地區(qū)開展大、中型外科手術，并為泉州地區(qū)培養(yǎng)了大批醫(yī)學骨干力量。近二十年來，內(nèi)科領域在相關學科帶頭人開拓領導下，學科建設長足發(fā)展，多個二級專業(yè)躍入省內(nèi)先進水平。目前支氣管封堵術、眼視光學與低視力康復、心血管疾病的胎兒起源研究等專項技術達國際先進水平，介入呼吸病學、超聲醫(yī)學、皮膚醫(yī)學美容、骨質(zhì)疏松性骨折預防與治療、骨科生物力學達到國內(nèi)先進水平。風濕病與自體免疫病學是福建醫(yī)科大學重點培育學科。醫(yī)院是國際聯(lián)合低視力康復教育中心、國家人力資源和社會保障部博士后科研工作站、中國科學院生物物理研究所生物醫(yī)學技術中心臨床轉化基地、國家心血管疾病診療質(zhì)量監(jiān)測基地、衛(wèi)生計生委腦卒中篩查與防治基地、骨質(zhì)疏松性骨折二級預防項目協(xié)作單位、全國綜合醫(yī)院中醫(yī)藥工作示范單位、衛(wèi)生部和中國殘聯(lián)認定的低視力康復工程試點單位、國家級皮膚醫(yī)療美容示范基地、全國臨床藥師培訓基地、中國肺癌聯(lián)盟肺結節(jié)診治分中心，是福建醫(yī)學會變態(tài)反應學分會、福建超聲醫(yī)學工程學會、福建省視障康復技術指導中心、福建省低視力康復指導組、福建醫(yī)科大學肝膽胰疾病數(shù)字化技術臨床應用中心單位，是福建省危重癥孕產(chǎn)婦轉診救治網(wǎng)絡醫(yī)院，泉州市疑難急危重癥和孕產(chǎn)婦搶救中心。2014年，在國家級呼吸內(nèi)鏡培訓基地書面評審中，成績高居全國第三位。

醫(yī)院擁有核磁共振成像系統(tǒng)（MRI）、數(shù)字減影血管造影機（DSA）、雙源CT、直線加速器（LA）、單光子發(fā)射計算機斷層掃描儀（SP-ECT）、數(shù)字化胃腸造影機、流式細胞儀、PCR儀、彩色多普勒超聲心動圖、腹部彩色超聲波、血液透析機、體外循環(huán)機、電子直線加速器、數(shù)字高頻攝片機、骨密度儀、乳腺鉬靶、體外震波碎石機、神經(jīng)電生理檢查儀、電子胃鏡、電子腸鏡、電子支氣管鏡等先進儀器設備。優(yōu)秀的人才、精良的設備和完備的醫(yī)學專科為廣大民眾提供了全方位的醫(yī)療、保健服務。

醫(yī)院作為福建醫(yī)科大學第二臨床醫(yī)學院及省級醫(yī)學繼續(xù)教育基地之一，設有22個醫(yī)學教研室，現(xiàn)教授24人，副教授103人，博士研究生導師4人，碩士研究生導師51人，1998年開始招收全國統(tǒng)招碩士研究生，2003年開始招收全國統(tǒng)招博士研究生，2016年獲批國家人力資源與社會保障部博士后科研工作站并開始招生。依托自身免疫病研究室、介入超聲研究室、肝膽研究二室、耳鼻喉研究室、手外科研究室、糖尿病研究室、腎病研究室、骨科生物力學研究室、睡眠呼吸研究室等9個研究室和科研實驗室，倡導“創(chuàng)新、求實、嚴謹、規(guī)范”實驗室室訓，大力開展醫(yī)學科學研究。

醫(yī)院高度重視與國內(nèi)外的學術交流，與美國紐約大學、日本山梨醫(yī)科大學、日本鹿兒島大學、荷蘭自由大學等機構及學者建立了合作關系。近年醫(yī)院應邀出席國際會議并作專題發(fā)言32人次，31位國際學者來院開展學術交流，派出15位中青年骨干到美國、德國等國家研修。

1981年，經(jīng)省政府批準，醫(yī)院在本省率先建立華僑門診、華僑病區(qū)。十多年來接受大量來自美國、日本、新加坡、菲律賓、印度尼西亞、香港、臺灣及其他東南亞地區(qū)的病人。愛國僑胞熱心桑梓、慷慨解囊為醫(yī)院的建設作出了積極的貢獻。福建醫(yī)科大學附屬第二醫(yī)院歷任領導及全體同仁都非常珍視廣大僑胞及社會各界對該醫(yī)院的關愛及支持。

醫(yī)院先后被評為全國醫(yī)院文化建設先進單位、福建省平安醫(yī)院、福建省文明單位等榮譽。

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