（1）相同之處：均由表皮、皮層和維管柱3部分組成，各部分的細胞類型在根、莖中也基本上相同，根、莖中初生韌皮部發(fā)育順序均為外始式。

（2）不同之處是：

a、根表皮具根毛、無氣孔，莖表皮無根毛而往往具氣孔。

b、根中有內皮層，內皮層細胞具凱氏帶，維管柱有中柱鞘；而大多數(shù)雙子葉植物莖中無顯著的內皮層，雖談不上具凱氏帶，莖維管柱也無中柱鞘。

c、根中初生木質部和初生韌皮部相間排列，各自成束，而莖中初生木質部與初生韌皮部內外并列排列，共同組成束狀結構。

d、根初生木質部發(fā)育順序是外始式，而莖中初生木質部發(fā)育順序是內始式。

e、根中無髓射線，有些雙子葉植物根無髓，莖中央為髓，維管束間具髓射線。

根和莖的這些差異是由二者所執(zhí)行的功能和所處的環(huán)境條件不同決定的。