原始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的合成

啟動(dòng)

RNA聚合酶正確識(shí)別DNA模板上的啟動(dòng)子并形成由酶、DNA和核苷三磷酸（NTP）構(gòu)成的三元起始復(fù)合物，轉(zhuǎn)錄即自此開(kāi)始。DNA模板上的啟動(dòng)區(qū)域常含有TATAATG順序，稱(chēng)普里布諾（Pribnow）盒或P盒。復(fù)合物中的核苷三磷酸一般為GTP，少數(shù)為ATP，因而原始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的5′端通常為三磷酸鳥(niǎo)苷（pppG）或腺苷三磷酸（pppA）。真核DNA上的轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)區(qū)域也有類(lèi)似原核DNA的啟動(dòng)區(qū)結(jié)構(gòu)，和在-30bp（即在酶和DNA結(jié)合點(diǎn)的上游30核苷酸處，常以—30表示，bp為堿基對(duì)的簡(jiǎn)寫(xiě)）附近也含有TATA結(jié)構(gòu)，稱(chēng)霍格內(nèi)斯(Hogness)盒或 TATA盒。第一個(gè)核苷三磷酸與第二個(gè)核苷三磷酸縮合生成3′-5′磷酸二酯鍵后，則啟動(dòng)階段結(jié)束，進(jìn)入延伸階段。

延伸

σ亞基脫離酶分子，留下的核心酶與DNA的結(jié)合變松，因而較容易繼續(xù)往前移動(dòng)。核心酶無(wú)模板專(zhuān)一性，能轉(zhuǎn)錄模板上的任何順序，包括在轉(zhuǎn)錄后加工時(shí)待切除的居間順序。脫離核心酶的σ亞基還可與另外的核心酶結(jié)合，參與另一轉(zhuǎn)錄過(guò)程。隨著轉(zhuǎn)錄不斷延伸，DNA雙鏈順次地被打開(kāi)，并接受新來(lái)的堿基配對(duì)，合成新的磷酸二酯鍵后，核心酶向前移去，已使用過(guò)的模板重新關(guān)閉起來(lái)，恢復(fù)原來(lái)的雙鏈結(jié)構(gòu)。一般合成的RNA鏈對(duì)DNA模板具有高度的忠實(shí)性。RNA合成的速度，原核為25～50個(gè)核苷酸／秒，真核為45～100個(gè)核苷酸／秒。

終止

轉(zhuǎn)錄的終止包括停止延伸及釋放RNA聚合酶和合成的RNA。在原核生物基因或操縱子的末端通常有一段終止序列即終止子；RNA合成就在這里終止。原核細(xì)胞轉(zhuǎn)錄終止需要一種終止因子ρ（四個(gè)亞基構(gòu)成的蛋白質(zhì)）的幫助。真核生物DNA上也可能有轉(zhuǎn)錄終止的信號(hào)。已知真核DNA轉(zhuǎn)錄單元的3′端均含富有AT的序列〔如AATAA(A)或ATTAA(A)等〕，在相隔0～30bp之后又出現(xiàn)TTTT順序（通常是3～5個(gè)T），這些結(jié)構(gòu)可能與轉(zhuǎn)錄終止或者與3′端添加多聚A順序有關(guān)。