人類對微生物的利用甚早。我國在利用微生物方面，更有著豐富的經(jīng)驗和悠久的歷史。公元前3世紀，在《呂氏春秋》里就有“儀狄作酒禹飲而甘之”之說。公元前14世紀的《書經(jīng)》上記載著“著作酒醴爾惟曲蘗”，意思是如果要釀酒的話，就要將發(fā)芽的谷物發(fā)霉而做成曲種。在公元6世紀，后魏賈思勰所著的《齊民要術(shù)》一書中就詳細記載了制曲和釀酒的技術(shù)，還記載了栽種豆科植物可以肥沃土壤，當時雖不知根瘤菌的存在，也不知固氮作用，而會利用根瘤菌積累氮肥，等等。

　　19世紀末和20世紀初，微生物學被牢固地建立起來。其后，它的主要發(fā)展有兩個方面：一是研究傳染病和免疫學，研究疾病的防治和化學治療劑的功效；另一方面是和遺傳學的結(jié)合。

　　隨著社會經(jīng)濟發(fā)展的需要，人們不斷加強對微生物的研究，已形成了許多微生物學的分支學科。例如有普通微生物學、微生物生理學、微生物生態(tài)學、微生物遺傳學；有病毒學、細菌學、真菌學；還有土壤微生物學、海洋微生物學；再有醫(yī)學微生物學、工業(yè)微生物學、農(nóng)業(yè)微生物學、環(huán)保微生物學、醫(yī)學教.育網(wǎng)搜集整理石油微生物學等等，所以，微生物學的發(fā)展歷史是輝煌的。