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變性高效液相色譜技術(shù)

2011-01-25 08:19 來源:
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  變性高效液相色譜 (denaturing high performance liquid chromatography, DHPLC)是一項(xiàng)在單鏈構(gòu)象多態(tài)性 (SSCP)和變性梯度凝膠電泳 (DGGE)基礎(chǔ)上發(fā)展起來的新的雜合雙鏈突變檢測(cè)技術(shù),可自動(dòng)檢測(cè)單堿基替代及小片段核苷酸的插入或缺失。DHPLC檢測(cè)變異的基本原理:將工作溫度 (柱溫 )升高使DNA片段開始變性,部分變性的DNA可被較低濃度的乙腈洗脫下來。由于異源雙鏈 (錯(cuò)配的 ) DNA與同源雙鏈DNA的解鏈特征不同,在相同的部分變性條件下,異源雙鏈因有錯(cuò)配區(qū)的存在而更易變性,被色譜柱保留時(shí)間短于同源雙鏈,故先被洗脫下來,從而在色譜圖中表現(xiàn)為雙峰或多峰的洗脫曲線。這一技術(shù)最先由Oefner于 1 995年建立,目前全球使用最多也最易操作的是美國(guó)transgenomic公司開發(fā)的WAVE 核苷酸片段分析系統(tǒng),它通過一個(gè)獨(dú)特的DNA色譜柱—DNA Sep柱進(jìn)行核酸片段的分離和分析。

  方法學(xué)比較研究表明,DHPLC敏感性和特異性可達(dá) 96%~100 %,明顯高于常用的DGGE、CCM、CSGE、SSCP等變異檢測(cè)技術(shù)。目前只有基于毛細(xì)管電泳技術(shù)發(fā)展起來的熒光單鏈構(gòu)像多態(tài)性分析(F-SSCP)在敏感性和特異性方面能與DHPLC相媲美。但PCR引物的設(shè)計(jì)、PCR方法及條件、醫(yī)學(xué)教|育網(wǎng)|收集整理分離溫度及分離梯度等關(guān)鍵因素也影響DHPLC檢測(cè)敏感性。目前,該技術(shù)在基因突變檢測(cè)、DNA微衛(wèi)星鑒定、腫瘤雜合性缺失的檢測(cè)、RT-PCR的競(jìng)爭(zhēng)性定量、基因作圖、細(xì)菌鑒定、DNA片段大小測(cè)定及寡核苷酸的分析和純化等許多基因組研究領(lǐng)域中應(yīng)用廣泛,最近已被進(jìn)一步應(yīng)用到mRNA的檢測(cè),鑒定差異表達(dá)的基因。

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