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我科研人員首提“人類泛基因組”概念

2009-12-09 15:53 來源:李 斌
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  經(jīng)過不懈研究和攻關(guān),我國科研人員在人類基因組研究中獲得新的重大進(jìn)展——發(fā)現(xiàn)人類基因組中存在著種群特異甚至個體獨有的DNA序列和功能基因??蒲腥藛T還首次提出了“人類泛基因組”的概念。

  由深圳華大基因研究院領(lǐng)銜、華南理工大學(xué)參與的研究論文《構(gòu)建人類泛基因組序列圖譜》12月7日在國際著名科學(xué)期刊《自然》的生物技術(shù)分刊(《Nature Biotechnology》)上發(fā)表。

  在研究中,科研人員運用第二代測序技術(shù)和自主研發(fā)的基因組組裝工具,對“炎黃一號”基因組——首個亞洲人個人基因組進(jìn)行了進(jìn)一步的深度測序和拼接,發(fā)現(xiàn)人類基因組中除原先公認(rèn)的單核甘酸多態(tài)性、插入刪除多態(tài)性和結(jié)構(gòu)性變異以外,還存在著種群特異甚至個體獨有的DNA序列和功能基因,例如主要在亞洲人群內(nèi)特有的基因序列。

  科研人員同時對近兩年發(fā)表的非洲人基因組和韓國人基因組進(jìn)行了重新組裝,也得到類似結(jié)論??蒲腥藛T還首次提出了“人類泛基因組”的概念,即人類群體基因序列的總和。

  國際人類基因計劃基于歐洲人DNA完成的參考基因組序列,是目前絕大多數(shù)人類基因組學(xué)研究的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。多年來,大多數(shù)科學(xué)研究都認(rèn)為每個個體的基因組均與這一參考基因組相似,僅有替換或重排性質(zhì)的變化醫(yī)學(xué)教.育網(wǎng)搜集整理。

  專家指出,這一研究建立了新的人類基因組測序標(biāo)準(zhǔn),進(jìn)一步證明自主構(gòu)建中國人群醫(yī)學(xué)基因組學(xué)圖譜、推進(jìn)個人基因組研究和個體化醫(yī)學(xué)研究的必要性,是中國科學(xué)家在人類基因組研究領(lǐng)域的又一重要貢獻(xiàn)。

  在論文同行匿名審稿過程中,一名科學(xué)家評價說:“這是一篇激動人心,發(fā)人深省,嚴(yán)謹(jǐn)清晰的文章。除了對新序列的檢出和分類,這篇文章還通過使用相當(dāng)有趣的獨創(chuàng)的分析方法,增強(qiáng)了我們對這些新序列中所能展示的種群多樣性和進(jìn)化保守性的認(rèn)識。”

  值得一提的是,論文作者羅銳邦、金鑫同屬華南理工大學(xué)——深圳華大基因研究院基因組科學(xué)創(chuàng)新班的本科學(xué)生。今年8月,來自創(chuàng)新班的另一位學(xué)生邵浩靖在《科學(xué)》雜志參與發(fā)表了題為《40個基因組的重測序揭示了蠶的馴化事件及馴化相關(guān)基因》的論文。

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