吡啶類：主要是喹喏里西啶類（苦參所含生物堿，如苦參堿）。

莨菪烷類：洋金花所含生物堿，如莨菪堿。

異喹啉類：主要有芐基異喹啉類（如罌粟堿）、雙芐基異喹啉類（漢防己所含生物堿，如漢防己甲素）、原小檗堿類（黃連所含生物堿，如小檗堿）和嗎啡類（如嗎啡、可待因）。

吲哚類：主要有色胺吲哚類（如吳茱萸堿）、單萜吲哚類（馬錢子所含生物堿，如士的寧）、二聚吲哚類（如長春堿、長春新堿）。

萜類：烏頭所含生物堿（如烏頭堿）、紫杉醇。

甾體：貝母堿

有機胺類：麻黃所含生物堿，如麻黃堿、偽麻黃堿。