在敗血癥期，主要病變?yōu)檠軆?nèi)皮損害，血管壁炎癥、壞死和血栓形成同時(shí)有血管周圍出血；皮膚、皮下組織、粘膜和漿膜等局灶性出血。

　　暴發(fā)敗血癥死亡者尸檢時(shí)，于皮膚血管內(nèi)皮細(xì)胞內(nèi)及腔內(nèi)可見大量革蘭氏陰性雙球菌，皮膚及內(nèi)臟血管損害嚴(yán)重而廣泛，內(nèi)皮細(xì)胞脫落壞死，血管腔內(nèi)有纖維蛋白—白細(xì)胞—血小板形成的血栓。皮膚、肺、心、胃腸道和腎上腺均有廣泛出血。心肌炎和肺水腫亦常見。

　　腦膜炎期的病變以軟腦膜為主。早期充血、少量漿液性滲出及局灶性小出血點(diǎn)。后期則有大量纖維蛋白、中性粒細(xì)胞及血漿外滲。病變主要在大腦兩半球表面和顱底。由于顱底膿液粘稠及化膿性病變的直接侵襲，可引起腦膜粘連、引起加重視神經(jīng)、外展神經(jīng)及動(dòng)眼神經(jīng)、面神經(jīng)、聽神經(jīng)等顱神經(jīng)損害。由于內(nèi)毒素的損傷使腦神經(jīng)組織表層發(fā)生退行性病變。此外，炎癥亦可沿著血管壁侵入腦組織，引起充血、水腫、局灶性中性粒細(xì)胞浸潤及出血。

　　在暴發(fā)型腦膜炎病例中，病變以腦組織為主，有明顯充血水腫，顱內(nèi)壓增高。當(dāng)水腫的腦組織向顱內(nèi)的裂孔突出，則形成枕骨大孔或天幕裂孔疝。

　　少數(shù)患兒由于腦室膜炎，大腦導(dǎo)水管阻塞，致腦脊液循環(huán)受阻而發(fā)生腦積水。醫(yī)學(xué)|教育網(wǎng)|整理

　　除腦脊髓膜外，其他臟器亦可有遷徙性化膿性病灶，包括心內(nèi)膜炎、心包炎、化膿性關(guān)節(jié)炎、肺炎、眼球炎等。