不同的殺菌劑的作用方式也不同。在病菌侵染前施于植物表面起預防保護作用的，稱為保護性殺菌劑即保護劑；在施藥部位能消滅已侵染病菌的，稱為鏟除性殺菌劑；能被植物吸收并在體內傳導至病菌侵染的部位而消滅病菌的，稱為內吸性殺菌劑，許多鏟除劑也是內吸劑，兩者大多有化學治療作用。因此，實用上常簡單地將殺菌劑分成保護性和內吸性兩種作用方式。它們的作用機理，也可大致分為兩類：1、干擾病菌的呼吸過程，抑制能量的產生。2、干擾菌體生命物質如蛋白質、核酸、甾醇等的生物合成。保護性殺菌劑大多為殺菌譜廣而殺菌力較低的產品。內吸性殺菌劑一般殺菌力較強，殺菌譜則較窄，其中有些品種對某種病原菌有專一的選擇毒性。由于內吸劑在菌體內的作用點比較單一，病菌容易由遺傳基因的突變而產生抗藥性。為了避免或延緩抗藥性的產生，通?？蛇x擇適當的保護劑和內吸劑混合施用或輪換使用，這樣可取長補短得到較好的防治效果。在使用時應根據病害發(fā)生的特點，采取種子處理、葉面噴布和土壤處理等各種施藥方法。