浙江中醫(yī)藥大學信息技術學院設有4個教研室、一個研究室、一個校級教學實驗中心、一個計算機科學與技術本科專業(yè)，2005年，計算機科學與技術專業(yè)被學校確定為校級重點專業(yè)；直屬計算機系黨支部被中共浙江省教育工委授予“三樹一創(chuàng)”好班子的稱號；醫(yī)學信息技術教學實驗中心被列為“浙江省基礎課實驗示范中心建設”項目；2006年度學院被評為學校先進單位；2007年學院被評為校級優(yōu)秀教學單位；2007年，物理教研室、計算機專業(yè)（1）教研室被評為學校優(yōu)秀示范教研室。學院現(xiàn)有《計算機文化基礎》、醫(yī)學|教育網搜集整理《計算機網絡基礎》、《大學物理實驗》等三門校級精品課程。

信息技術學院承擔了計算機科學與技術專業(yè)、全校非計算機專業(yè)的信息類課程和全校物理類課程的教學工作；同時還負責校園網管理工作。