福建醫(yī)科大學創(chuàng)建于1937年，其前身是福建省立醫(yī)學專科學校。1939年改名為福建省立醫(yī)學院。1949年改稱福建醫(yī)學院。1969年，與福建中醫(yī)學院、華僑大學醫(yī)療系合并，成立福建醫(yī)科大學。1982年更名為福建醫(yī)學院。1996年4月改為現(xiàn)名。

經(jīng)過70多年的建設發(fā)展，學校已形成學士—碩士—博士人才培養(yǎng)體系和“勤奮、嚴謹、求實、創(chuàng)新”優(yōu)良校風，成為一所集教學、科研、醫(yī)療、預防和社會服務為一體的省屬醫(yī)科大學。2003年，被福建省人民政府確定為重點建設高校。同年以良好的成績通過了教育部本科教學工作水平評估。

學�，F(xiàn)有上街、臺江2個校區(qū)，占地1300余畝，校舍建筑面積40.9萬平方米。學校多次被評為福建省黨建和思想政治工作先進高校、省文明學校、省“依法治校”示范校、省“校務公開”示范校、省計劃生育先進單位、省衛(wèi)生先進單位、省綠化模范單位和省級花園式單位等。2008年9月，學校被授予“全國教育系統(tǒng)抗震救災先進集體”榮譽稱號。

學�，F(xiàn)有19個學院、部，即基礎醫(yī)學院、公共衛(wèi)生學院、藥學院、護理學院、口腔醫(yī)學院、醫(yī)學技術(shù)與工程學院、人文學院、研究生教育學院、海外教育學院、成人教育學院、職業(yè)技術(shù)學院、繼續(xù)教育學院、第一臨床醫(yī)學院、第二臨床醫(yī)學院、協(xié)和臨床醫(yī)學院、省立臨床醫(yī)學院、�？偱R床醫(yī)學院、海峽學院和體育教研部；25個本科專業(yè)（方向），即臨床醫(yī)學（本碩連讀）、臨床醫(yī)學、臨床醫(yī)學（臨床病理學方向）、臨床醫(yī)學（急救醫(yī)學方向）、口腔醫(yī)學、醫(yī)學檢驗、麻醉學、醫(yī)學影像學、臨床醫(yī)學（眼與視光學方向）、康復治療學、預防醫(yī)學、預防醫(yī)學（檢驗檢疫方向）、預防醫(yī)學（婦幼保健方向）、護理學、藥學、藥學（臨床藥學方向）、藥學（藥物分析方向）、藥學（藥物制劑方向）、藥物制劑、應用心理學、英語、社會工作、公共事業(yè)管理、公共事業(yè)管理（衛(wèi)生管理方向）、公共事業(yè)管理（醫(yī)院管理方向）；博士學位授權(quán)點22個，碩士學位授權(quán)點59個、專業(yè)碩士學位授權(quán)點2個。目前，各類在校生22000多人，其中本科生11000多人，博士、碩士生2100多人，本科專業(yè)面向全國21個省、直轄市、自治區(qū)和港澳臺地區(qū)招生。

學�，F(xiàn)有教職醫(yī)護員工5491人，其中校本部963人。在835名專任教師中，具有研究生學位占61.32%，高級職稱占58.56%.博士生導師65名，碩士生導師454名。享受國務院特殊津貼專家100人，“新世紀百千萬人才工程”國家級人選5人，國家有突出貢獻中青年專家4人，衛(wèi)生部有突出貢獻中青年專家4人，教育部優(yōu)秀青年教師資助3人，教育部骨干教師資助8人，福建省優(yōu)秀專家17人，“福建省百千萬人才工程”人選64人，福建省高校教學名師8人，福建省高校新世紀優(yōu)秀人才支持計劃人選28人，福建省高校創(chuàng)新團隊2個。

學校有附屬醫(yī)院（含臨床醫(yī)學院）11所，其中10所綜合性附屬醫(yī)院（含臨床醫(yī)學院） 均為三級甲等醫(yī)院，即附屬第一醫(yī)院、附屬第二醫(yī)院、附屬協(xié)和醫(yī)院、省立臨床醫(yī)學院（省立醫(yī)院）、�？偱R床醫(yī)學院（南京軍區(qū)福州總醫(yī)院）、附屬廈門第一醫(yī)院附屬漳州市醫(yī)院、附屬泉州第一醫(yī)院、附屬三明第一醫(yī)院和附屬龍巖市第一醫(yī)院；附屬口腔醫(yī)院1 所。此外，有臨床教學醫(yī)院28所，形成了比較完善的臨床教學與實踐教學基地網(wǎng)絡。

目前，學校現(xiàn)有臨床醫(yī)學和基礎醫(yī)學2個博士后科研流動站，科研機構(gòu)65個，省重點學科13個，學校重點學科6個，省高校重點實驗室3個，承擔著大量的科研任務，成果顯著。學校編輯出版的學術(shù)刊物《福建醫(yī)科大學學報》、《福建醫(yī)科大學學報（社科版）》、《中華高血壓雜志》和《心血管康復醫(yī)學雜志》等，面向國內(nèi)外公開發(fā)行。學校圖書館面積25600平方米，圖書、資料164萬冊，是福建省醫(yī)學圖書中心館。

“十一五”期間，我校將以黨的十七大精神為指導，推進學校新一輪發(fā)展，成為辦學規(guī)模適度，學科結(jié)構(gòu)合理，辦學層次較高，整體實力較強；以普通本科教育為主，加快發(fā)展研究生教育和長學制醫(yī)學教育；以醫(yī)學為主，理學、管理學、法學等多學科協(xié)調(diào)發(fā)展的教學研究型省屬重點醫(yī)科大學，努力建設為海峽西岸經(jīng)濟區(qū)建設服務的創(chuàng)新藥物研究開發(fā)平臺、基礎醫(yī)學研究創(chuàng)新平臺、臨床醫(yī)學診療創(chuàng)新平臺、公共衛(wèi)生服務創(chuàng)新平臺、醫(yī)學實驗動物服務平臺和醫(yī)學創(chuàng)新人才培養(yǎng)平臺等六大平臺，成為海峽西岸高級醫(yī)藥衛(wèi)生人才培養(yǎng)中心、醫(yī)學科學研究中心和醫(yī)療預防保健中心，跨入國內(nèi)同類高校的先進行列。