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歷史沿革。我校創(chuàng)建于1949年，時稱華東軍區(qū)人民醫(yī)學院。1950年改稱上海軍醫(yī)大學。1951年7月正式定名為第二軍醫(yī)大學。

整體實力。學校是國家“211工程”和軍隊“2110工程”重點建設(shè)院校，是軍隊3所設(shè)置研究生院的單位之一，是全國11所開辦八年制醫(yī)學教育的院校之一，是36個“國家生命科學與技術(shù)人才培養(yǎng)基地”之一，是我軍唯一的外軍醫(yī)學留學生培訓基地。

體制編制。機關(guān)設(shè)四部一院（訓練部、政治部、校務(wù)部、科研部和研究生院），下轄一部（基礎(chǔ)部）、六系（海軍醫(yī)學系、藥學系、衛(wèi)生勤務(wù)學系、護理系、中醫(yī)系、外訓系）、研究生管理大隊、3所附屬醫(yī)院、5個干休所。

人才培養(yǎng)。學校的主要培訓層次有研究生教育、本科生教育、任職教育和留學生教育等。開設(shè)長學制醫(yī)學教育（七、八年制）、臨床醫(yī)學（五年制）、海軍臨床醫(yī)學（五年制）、麻醉學（五年制）、藥學（四年制）、護理學（四年制）、公共事業(yè)管理（四年制）、生物技術(shù)（四年制）、中醫(yī)學（五年制）等9個專業(yè)。校黨委始終堅持教學工作的中心地位不動搖、教學改革的核心地位不動搖、教學基本建設(shè)的優(yōu)先地位不動搖，穩(wěn)步推進教學改革，狠抓教學質(zhì)量建設(shè)。“十五”以來，共獲得國家教學成果獎3項，軍隊教學成果一等獎3項、二等獎9項。先后有10篇研究生論文入選“全國百篇優(yōu)秀博士學位論文”。

學科水平。實施了“1272”學科建設(shè)工程，大力推進學科建設(shè)�，F(xiàn)有國家重點學科一級學科2個（基礎(chǔ)醫(yī)學、藥學），二、三級學科26個，軍隊“2110工程”重點建設(shè)學科3個（航海醫(yī)學、軍事生物工程和野戰(zhàn)內(nèi)科學），總后“530工程”重點建設(shè)學科2個（軍隊衛(wèi)生勤務(wù)學和野戰(zhàn)護理學），上海市重點學科7個�，F(xiàn)有博士后流動站6個，博士學位授權(quán)一級學科6個，博士學位授權(quán)二、三級學科61個，碩士學位授權(quán)二、三級學科78個；學位授權(quán)學科涉及醫(yī)學、法學、教育學、文學、理學、工學、管理學7大門類，基本覆蓋學�，F(xiàn)有學科專業(yè)，覆蓋率達到95.7%.現(xiàn)有國家重點實驗室1個：醫(yī)學免疫學；教育部重點實驗室1個：分子神經(jīng)生物學。擁有全軍重點實驗室10個，其中免疫與基因治療實驗室、生物信號轉(zhuǎn)導實驗室和藥物化學實驗室被評為全軍“重中之重”重點建設(shè)實驗室。

師資隊伍。實施了“5511”人才建設(shè)工程，全面推行科室主任聘任制�？萍几刹筷犖橹�，有兩院院士4名（中科院院士：吳孟超、陳宜張，工程院院士：曹雪濤、王紅陽），“長江學者獎勵計劃”特聘教授4名（曹雪濤、王紅陽、夏照帆、何成）、“973”首席科學家3名（曹雪濤、郭亞軍、潘衛(wèi)慶），榮獲全軍專業(yè)技術(shù)重大貢獻獎和軍隊專業(yè)技術(shù)人才獎4人（吳孟超、廖萬清、曹雪濤、李兆申），國家有突出貢獻中青年專家6名（戚中田、朱明學、張寶仁、廖萬清、賈連順、侯春林）、“百千萬人才工程”國家級人選5名（曹雪濤、戚中田、何成、夏照帆、楊甲梅）、“中國青年科技獎”5名（曹雪濤、何成、章衛(wèi)平、蔣春雷、張衛(wèi)東）、總后“三星”人才41名、一代名師和伯樂獎22名，上海市醫(yī)學領(lǐng)軍人物9名。博士生導師184名，碩士生導師414名。

科技創(chuàng)新。學校積極推進科研管理體制改革和機制創(chuàng)新，加強重大、重點項目的研究和聯(lián)合攻關(guān)，著力活躍學術(shù)氛圍，促進了科研規(guī)模、水平、效益的持續(xù)發(fā)展。近三年，學校共承擔各類縱向科研課題653項，經(jīng)費2.1億多元。其中，承擔國家自然科學基金面上項目270項，重點、重大項目6項。共獲軍隊級（含省部級）以上科技成果獎共196項。其中國家最高科學技術(shù)獎1項，國家自然科學二等獎1項，國家技術(shù)發(fā)明二等獎1項，國家科技進步二等獎2項，上海市自然科學一等獎1項，上海市科技進步一等獎6項，軍隊醫(yī)療成果獎一等獎5項，中華醫(yī)學科技一等獎1項，上海市醫(yī)學科技一等獎4項，軍隊科技進步二、三等獎36項，軍隊醫(yī)療成果二、三等獎70項。

醫(yī)院建設(shè)。學校附屬長海、長征和東方肝膽外科醫(yī)院以“救死扶傷，服務(wù)軍民”為宗旨，堅持科技興院、質(zhì)量建院、從嚴治院、勤儉辦院，醫(yī)院整體建設(shè)水平在軍內(nèi)外領(lǐng)先，目前，共展開床位3500余張，年收治病人6萬多人次，年門急診量達200多萬人次。在醫(yī)療特色上，肝膽外科、胸心外科、燒傷外科、骨科、神經(jīng)外科、泌尿外科等傳統(tǒng)特色更加鮮明，并在肝臟、腎臟等器官移植術(shù)，前列腺疾病微創(chuàng)治療術(shù)，以及胰腺疾病、血管病、血液病、真菌病診治技術(shù)等方面形成新的特色。目前，三所附屬醫(yī)院共有10個全軍醫(yī)學研究所，10個全軍醫(yī)學專科（專�。┲行�，3個國家中醫(yī)藥管理局重點�？疲▽２。┲行�，4個上海市臨床醫(yī)學中心。三所醫(yī)院均為三級甲等醫(yī)院，長海醫(yī)院榮獲“全國百佳醫(yī)院”稱號，長征醫(yī)院在全軍開展的優(yōu)質(zhì)服務(wù)競賽中連續(xù)三屆榮獲“白求恩杯”，東方肝膽外科醫(yī)院已發(fā)展成為國家軍隊知名的�？漆t(yī)院。