全科醫(yī)師在診療過程中應當遵循的主要倫理原則包括：
1. 尊重病人自主權：尊重病人的選擇和意愿，確保患者充分知情并同意治療方案。這要求醫(yī)生提供足夠的信息，以便患者能夠理解自己的病情、可能的治療選項以及每種選擇的風險與益處。
2. 遵守保密性原則：保護患者的隱私和個人信息安全，不泄露其醫(yī)療記錄或個人信息給無關人員，除非得到本人明確授權或者法律另有規(guī)定。
3. 公正公平地對待每一位患者：無論性別、年齡、種族、宗教信仰、經(jīng)濟狀況等因素如何，都應平等對待所有求醫(yī)者，提供同樣標準的醫(yī)療服務。
4. 有利原則（行善）與無害原則（避免傷害）：在制定治療計劃時，要考慮到對患者的潛在好處和風險。盡量選擇那些能夠帶來最大利益且最小化不良后果的方法。
5. 堅持專業(yè)誠信：保持誠實、正直的態(tài)度，不夸大病情也不隱瞞事實真相；對于自己不確定的問題應及時尋求專家意見或轉診至更高級別的醫(yī)療機構。
6. 持續(xù)學習與自我提升：不斷更新自己的醫(yī)學知識和技術水平，以提供更加高效準確的醫(yī)療服務。

以上就是全科醫(yī)師在診療中應該遵循的主要倫理原則。