微生物最主要的的特點就是體積小，種類多，繁殖迅速，適應(yīng)環(huán)境能力強。微生物廣泛分布于自然界中?？梢哉f，凡是它們能夠生存的地方，都是它們的家園。當然，微生物聚集最多的地方還是土壤，那里為微生物生長提供了所需要的各種基本要素，而且還具有保溫性能好、緩沖性強等優(yōu)點，因此，土壤是微生物的大本營，是人類最豐富的菌種資源庫。土壤中尤以細菌最多，約占土壤微生物總量的70-90%.土壤中不同類型的細菌有不同的作用。有的能夠固定空氣中的氮元素，合成細胞中的蛋白質(zhì)；有的能夠分解農(nóng)作物的秸桿，它們大多是異養(yǎng)菌。除了細菌以外，土壤中數(shù)量較多的其它微生物是放線菌（抗生素的主要產(chǎn)生菌）和真菌，而藻類和原生動物等較少。土壤微生物是構(gòu)成土壤肥力的重要因素。

　　在陰濕的土壤、潮濕的朽木、腐爛的植物和堆肥上，還生活著另一些微生物，叫做粘菌。它們是一類營養(yǎng)方式和生活史近似于原生動物，但又近似于真菌的真核微生物，也有人稱之為粘菌蟲（mycetozoa）。在粘菌的生活史中，有一階段能形成一塊有許多細胞核的象變形蟲狀的原生質(zhì)團，這種原生質(zhì)團能自由生活、外包有無定形的膠質(zhì)鞘、無細胞壁、內(nèi)不含葉綠素。它們借助于偽足伸縮來行動，營養(yǎng)方式為吞咽式或吸收式。原生質(zhì)團生長到某一階段，在一定的環(huán)境條件下，可轉(zhuǎn)變成為顏色艷麗的子實體并產(chǎn)生孢子。發(fā)網(wǎng)菌就是粘菌中的一種。

　　水環(huán)境包括江、河、湖泊等淡水環(huán)境以及海洋等咸水環(huán)境。水中溶解或懸浮著多種無機或有機物質(zhì)，可供給微生物生長繁殖所需要的營養(yǎng)。因此，水環(huán)境是微生物棲息的第二天然場所。城市的生活污水以及工業(yè)廢水，有機物含量高，種類復(fù)雜，其中的微生物多數(shù)為腐生型細菌和原生動物，能夠在天然水體的自凈和污水處理中發(fā)揮作用。海水中的微生物多為嗜鹽菌，有些細菌能發(fā)光，對一些化學藥劑與毒物敏感，可用于環(huán)境污染物的監(jiān)測。

　　空氣雖然不是微生物生長繁殖的良好場所，但土壤、水體、各種腐爛的有機物以及人和動物、植物體上的微生物，都可隨著氣流的運動被攜帶到空氣中去?？諝庵械奈⑸锓植己懿痪鶆颍丝诔砻艿貐^(qū)上空的微生物數(shù)量較多?？諝庵械奈⑸镏饕懈鞣N球菌、芽孢桿菌、產(chǎn)色素細菌以及對干燥和射線有抵抗力的真菌孢子。在人口稠密、污染嚴重的城市，尤其是在醫(yī)院或患者的居室附近，空氣中還可能有較多的病原菌?？諝庵械奈⑸锱c動植物病害的傳播、發(fā)酵工業(yè)的污染以及工農(nóng)業(yè)產(chǎn)品的霉腐變質(zhì)有很大關(guān)系醫(yī)學教`育網(wǎng)搜集整理。

　　各種農(nóng)產(chǎn)品經(jīng)常會受到微生物的危害，主要是霉菌，有些黃曲霉產(chǎn)生的黃曲霉毒素對人、畜危害極大，而且有致癌作用。許多食品、工業(yè)產(chǎn)品也經(jīng)常受到霉腐微生物的侵蝕和破壞，因此，霉腐微生物的防治一直是工業(yè)、農(nóng)業(yè)及食品衛(wèi)生行業(yè)工作的重點之一。

　　人體及動物體上的微生物，在正常情況下，是有益無害的正常菌群。但當機體防御機能減弱時，也會成為病原微生物。

　　此外，在植物的體表或體內(nèi)，還會有一些病原微生物存在，例如使植物發(fā)生病害的各種細菌、真菌和病毒等。