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基因測(cè)序揭示傳染病在醫(yī)院的傳播途徑

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2011年,美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院(NIH)臨床中心的17個(gè)病人,發(fā)生了血流感染事件,其中6人死亡。醫(yī)生得知其中一位6月住院的病人攜帶有克雷伯氏肺炎菌,但是不清楚這種被認(rèn)為是醫(yī)院獲得性感染一個(gè)常見罪魁禍?zhǔn)椎募?xì)菌,是如何傳來傳去或是否幾個(gè)不同的病人簡(jiǎn)單地感染了該細(xì)菌。通過采集病人身上和某些醫(yī)院設(shè)備上的樣品,并對(duì)不同菌株的基因進(jìn)行分析,研究人員追蹤了該病原體曲折的傳播途徑。

該項(xiàng)研究發(fā)表在《科學(xué)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)》上,是目前首例全基因組掃描技術(shù)在醫(yī)院暴發(fā)疫情期間的應(yīng)用。

該論文的作者、美國(guó)國(guó)家人類基因組研究所高級(jí)研究人員Julie Segre指出,基因測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用成為可能,主要是因?yàn)槠錅y(cè)試成本和速度足以實(shí)現(xiàn)近乎實(shí)時(shí)的測(cè)試。2011年每個(gè)基因測(cè)試的成本為2000美元,2012年已經(jīng)跌到了500美元。基因掃描結(jié)果顯示病菌源于1個(gè)病人,其他病人通過醫(yī)院感染該病菌的途徑比預(yù)計(jì)的有所不同,此外現(xiàn)有的醫(yī)院獲得性感染的應(yīng)對(duì)措施還不充分。與流行病學(xué)家預(yù)計(jì)的細(xì)菌從第一個(gè)病人跳到其他病人身上(此時(shí)有跡象表明此病人與第二個(gè)病人間發(fā)生了血液感染)不一樣,細(xì)菌的傳播方式更加復(fù)雜。分析顯示,1號(hào)病人將細(xì)菌分別傳給了3、4、8號(hào)病人,這些病人在1個(gè)多月后出現(xiàn)癥狀。8號(hào)病人身上攜帶的細(xì)菌并未進(jìn)行進(jìn)一步的傳播。而3號(hào)病人攜帶的細(xì)菌傳給了5號(hào)和2號(hào)病人,剩下的病人都是被4號(hào)病人所傳染。

研究人員認(rèn)為細(xì)菌是通過醫(yī)院工作人員的手傳播。此外,在一個(gè)病人使用過的呼吸機(jī)上面發(fā)現(xiàn)了細(xì)菌,這表明常見的清潔程序尚不足以清除掉機(jī)器上的細(xì)菌。盡管在本次研究中并未發(fā)現(xiàn)細(xì)菌通過呼吸機(jī)傳播,但是這種事情可能在其他任何地方發(fā)生。

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