微生物培養(yǎng)基根據(jù)其組成和用途，可以主要分為以下幾類：
1. 基礎(chǔ)培養(yǎng)基 這是最基本的一類培養(yǎng)基，只含有微生物生長所必需的基本營養(yǎng)成分如碳源、氮源等。這類培養(yǎng)基通常用于能利用簡單營養(yǎng)物質(zhì)的微生物。
2. 加富培養(yǎng)基 在基礎(chǔ)培養(yǎng)基的基礎(chǔ)上添加了某些特殊營養(yǎng)物質(zhì)或生長因子，以促進特定種類微生物的生長。比如血液瓊脂平板就是一種加富培養(yǎng)基，適合于多種細菌特別是病原菌的分離和鑒定。
3. 選擇性培養(yǎng)基 這類培養(yǎng)基中加入了抑制劑或其他成分來阻止非目標微生物的生長，從而有利于目標微生物的選擇性增殖。例如麥康凱瓊脂用于腸道桿菌的選擇性分離。
4. 鑒別培養(yǎng)基 此類培養(yǎng)基含有能夠使不同種類或類型的微生物產(chǎn)生明顯表型差異（如顏色變化、形態(tài)改變等）的特定成分，以便于快速鑒別和分類不同的微生物。比如三糖鐵瓊脂可以用來區(qū)分大腸埃希氏菌和其他腸道細菌。
5. 特殊用途培養(yǎng)基 根據(jù)實驗?zāi)康脑O(shè)計的一些特殊類型培養(yǎng)基，例如厭氧培養(yǎng)基用于培養(yǎng)嚴格厭氧微生物；微需氧培養(yǎng)基則適用于那些需要低濃度氧氣才能生長的微生物等。