人體內常見的致病性鞭毛蟲主要包括以下幾種：
1. 溶組織內阿米巴（Entamoeba histolytica）：雖然溶組織內阿米巴嚴格意義上不屬于鞭毛蟲，但其生活周期中存在一個具有鞭毛的階段。它主要引起阿米巴痢疾和肝膿腫。
2. 杜氏利什曼原蟲（Leishmania donovani）：這種寄生蟲可以導致黑熱病，通過白蛉叮咬傳播給人類。杜氏利什曼原蟲在人體內以無鞭毛體形式存在于巨噬細胞中，在媒介昆蟲體內則變?yōu)榫哂斜廾那氨廾w。
3. 錐蟲（Trypanosoma spp.）：如非洲睡眠病的病原體——岡比亞錐蟲和羅得西亞錐蟲，以及美洲錐蟲病（查加斯?。┑牟≡w——克魯茲錐蟲。這些寄生蟲通過吸血昆蟲傳播，在人體血液中以鞭毛體形式存在。
4. 藍氏賈第鞭毛蟲（Giardia lamblia 或 Giardia intestinalis）：這是一種廣泛分布于全球的腸道寄生蟲，主要引起賈第蟲病，表現(xiàn)為腹瀉、腹痛等癥狀。藍氏賈第鞭毛蟲在人體小腸內以滋養(yǎng)體形式生存，在外界環(huán)境中則形成囊包。

以上就是一些常見的人體內致病性鞭毛蟲，它們分別通過不同的途徑感染人類，并引發(fā)相應的疾病。臨床上對于這些寄生蟲的診斷通常需要結合流行病學史、臨床表現(xiàn)及實驗室檢查結果綜合判斷。