免疫系統(tǒng)能夠區(qū)分自身與非自身物質(zhì)，主要是通過一系列復雜的識別機制來實現(xiàn)的。首先，免疫細胞如T細胞和B細胞表面具有一系列受體，這些受體能夠特異性地識別特定的分子結(jié)構(gòu)，即抗原。人體內(nèi)的每個細胞都表達一種叫做主要組織相容性復合物（MHC）的蛋白質(zhì)，這種蛋白質(zhì)可以將細胞內(nèi)部的肽段展示在細胞表面。

正常情況下，免疫系統(tǒng)通過T細胞上的TCR（T細胞受體）與自身MHC分子結(jié)合的方式學習識別“自我”。在這個過程中，那些對自身抗原反應過于強烈的T細胞會被消除或轉(zhuǎn)化為調(diào)節(jié)性T細胞，以減少自身免疫疾病的發(fā)生。這一過程主要發(fā)生在胸腺中，被稱為中樞耐受。

當外來物質(zhì)如病毒、細菌等進入體內(nèi)時，它們的蛋白質(zhì)或其他分子結(jié)構(gòu)會被處理并展示在感染細胞表面的MHC上。這種非自身的抗原-MHC復合物能夠被T細胞識別，并觸發(fā)免疫反應。此外，B細胞也可以直接與某些類型的外源性抗原結(jié)合，進而啟動體液免疫應答。

總之，通過MHC分子、TCR及BCR（B細胞受體）等機制的共同作用，加上中樞和外周耐受機制，免疫系統(tǒng)能夠有效地識別并區(qū)分自身與非自身的物質(zhì)。