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氰化物可經由口服、吸入及皮膚黏膜被吸收到體內。氰化物由於可以抑制多種酶,被吸收後和細胞中線粒體上細胞色素氧化酶三價鐵離子產生絡合物,抑制細胞氧化磷酸化作用,阻斷能量ATP的生成,并使得細胞缺氧窒息。
一般而言,對於微量的氰化物人體可藉由與變性血紅素作用,而不是與色素氧化酶結合的方式,而達到排除毒性的效果。而氰化變性血紅素之後與一種硫化物轉移酶-硫氰酸生成酶作用,形成硫氰化銨錯合物。硫氰化銨由腎臟排泄(也就是由尿液排出)。當過多的氰化物進入人體,前述反應機制無法負荷,因而產生毒性。